La sepsis representa una de las principales causas de mortalidad en unidades de cuidados intensivos y se caracteriza por una respuesta inmunitaria desregulada frente a una infección, capaz de generar fallo multiorgánico. En los últimos años, la microbiota intestinal ha emergido como un actor clave en la fisiopatología de esta entidad, al participar activamente en la regulación inmunológica, el metabolismo y la integridad de la barrera intestinal. La disbiosis —definida por la pérdida de diversidad bacteriana y el predominio de taxones oportunistas como Enterococcus y Enterobacteriaceae— se asocia con hiperrespuesta inflamatoria, inmunoparálisis y mayor mortalidad. Esta revisión bibliográfica analiza la evidencia científica reciente sobre los mecanismos fisiopatológicos que vinculan la microbiota intestinal con la sepsis, la interacción del microbioma con la respuesta inmune del huésped y el impacto de los tratamientos antibióticos sobre su equilibrio y funcionalidad. Los estudios coinciden en que la sepsis provoca una profunda alteración microbiana acompañada de la pérdida de metabolitos inmunomoduladores —como los ácidos grasos de cadena corta— que agravan la disfunción inmunitaria y la permeabilidad intestinal. Asimismo, la terapia antibiótica, aunque esencial, contribuye a la disbiosis y favorece la colonización por patógenos resistentes. Estrategias emergentes como la administración de probióticos, simbióticos o el trasplante de microbiota fecal (FMT) muestran potencial para restaurar la homeostasis intestinal y modular la respuesta inmunológica, aunque la evidencia clínica aún es limitada. En conjunto, los hallazgos refuerzan el papel de la microbiota intestinal como modulador activo de la sepsis, marcador pronóstico y posible diana terapéutica, subrayando la necesidad de integrar su preservación en el abordaje clínico de los pacientes críticos.
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