Regulación transcripcional de la homeostasis del músculo estriado mediada por el complejo remodelador de la cromatina Chd4/NuRD
Autor/es: Hidalgo Estévez, Alicia María
Titulación: Máster Universitario en Bioinformática
Fecha de defensa: 2022-11
Tipo de contenido:
TFM
Resumen:
El mecanismo de contracción de los músculos esquelético y cardiaco es el mismo pero las
isoformas de las proteínas contráctiles, reguladoras y estructurales difiere entre ambos tipos de
músculo estriado. Esa expresión de proteínas diferenciada se debe a mecanismos epigenéticos
y a la regulación génica mediante factores de transcripción. Este trabajo de fin de máster estudia
el papel del complejo remodelador de la cromatina Chd4/NuRD y del factor de transcripción
ThPOK en la expresión de genes en músculo esquelético y cardiaco.
Para el estudio de expresión diferencial se empleó la plataforma de código abierto Galaxy. Se
analizaron los datos de RNA-seq procedentes de muestras de corazón y músculo tibial anterior
de los siguientes ratones: i) silvestres (WT), ii) knock-out condicionales para Chd4 (Chd4cKO), iii)
para ThPOK (ThPOK cKO) y iv) dobles knock-out Chd4cKO
- ThPOKcKO (dKO).
El análisis demostró diferencias en la expresión génica cuando se compararon los ratones
silvestres con los mutantes. Algunos de esos genes estaban relacionados con la contracción
muscular, indicando que Chd4 es necesario para la expresión diferencial de proteínas de
músculo estriado. Asimismo, se observó que la ausencia de los dos factores en corazón, Chd4 y
ThPOK, produce regulación positiva de genes implicados en la formación de un epitelio
cornificado, lo que corrobora los resultados obtenidos en el laboratorio del Dr. Gómez del Arco
Chd4, en los que se observó fallo cardiaco y fibrosis en el corazón de ratones.
Los resultados indican que Chd4 y ThPOK están implicados en el mantenimiento de la identidad
del músculo cardiaco y de su homeostasis.
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Formato: PDF
Tipo de contenido:
TFM