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    Regulación transcripcional de la homeostasis del músculo estriado mediada por el complejo remodelador de la cromatina Chd4/NuRD

    Autor/es: Hidalgo Estévez, Alicia María
    Director/es: Gómez del Arco, Pablo; Novillo Villajos, Apolonia
    Palabra/s clave: Homeostasis; Remodelación de la cromatina; Chd4/NuRD
    Titulación: Máster Universitario en Bioinformática
    Fecha de defensa: 2022-11
    Tipo de contenido: TFM
    URI: https://hdl.handle.net/20.500.12880/5119
    Resumen:
    El mecanismo de contracción de los músculos esquelético y cardiaco es el mismo pero las isoformas de las proteínas contráctiles, reguladoras y estructurales difiere entre ambos tipos de músculo estriado. Esa expresión de proteínas diferenciada se debe a mecanismos epigenéticos y a la regulación génica mediante factores de transcripción. Este trabajo de fin de máster estudia el papel del complejo remodelador de la cromatina Chd4/NuRD y del factor de transcripción ThPOK en la expresión de genes en músculo esquelético y cardiaco. Para el estudio de expresión diferencial se empleó la plataforma de código abierto Galaxy. Se analizaron los datos de RNA-seq procedentes de muestras de corazón y músculo tibial anterior de los siguientes ratones: i) silvestres (WT), ii) knock-out condicionales para Chd4 (Chd4cKO), iii) para ThPOK (ThPOK cKO) y iv) dobles knock-out Chd4cKO - ThPOKcKO (dKO). El análisis demostró diferencias en la expresión génica cuando se compararon los ratones silvestres con los mutantes. Algunos de esos genes estaban relacionados con la contracción muscular, indicando que Chd4 es necesario para la expresión diferencial de proteínas de músculo estriado. Asimismo, se observó que la ausencia de los dos factores en corazón, Chd4 y ThPOK, produce regulación positiva de genes implicados en la formación de un epitelio cornificado, lo que corrobora los resultados obtenidos en el laboratorio del Dr. Gómez del Arco Chd4, en los que se observó fallo cardiaco y fibrosis en el corazón de ratones. Los resultados indican que Chd4 y ThPOK están implicados en el mantenimiento de la identidad del músculo cardiaco y de su homeostasis.
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    Nombre: tfm_AliciaMariaHidalgoEstevez.pdf
    Tamaño: 2.127Mb
    Formato: PDF
    Tipo de contenido: TFM

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