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    Telómeros y longevidad desde la perspectiva de la secuenciación del genoma completo: comparación de software e interpretación de los resultados

    Autor/es: Carrillo Díez, Javier
    Director/es: Lacombe Antoneli, Ángela‖Gómez Román, Javier
    Palabra/s clave: Telómeros‖Longitud telomérica (LT)‖Secuenciación del genoma completo (WGS)‖Herramientas bioinformáticas‖Linux
    Titulación: Máster Universitario en Bioinformática
    Fecha de defensa: 2025-10
    Tipo de contenido: TFM
    URI: https://hdl.handle.net/20.500.12880/15011
    Resumen:
    La longitud telomérica (LT) constituye un biomarcador clave del envejecimiento biológico y de la susceptibilidad a múltiples enfermedades crónicas. La disponibilidad de datos de secuenciación del genoma completo (Whole Genome Sequencing, WGS) ha impulsado el desarrollo de herramientas bioinformáticas capaces de estimar la LT de manera no invasiva y reproducible. En este trabajo se llevó a cabo un estudio comparativo de cuatro programas de código abierto (TelSeq, Telomerecat, qMotif y Computel), aplicados a una cohorte de 43 individuos caucásicos españoles con edades entre 2 y 75 años, de los cuales el 65 % presentaba diagnóstico de hipertensión intracraneal idiopática (HII). El ADN se obtuvo a partir de muestras de saliva, secuenciado con tecnología Illumina NovaSeq 6000 (30x) y procesado mediante el pipeline DRAGEN Germline v3.9.5 para generar archivos FASTQ y BAM de alta calidad. Los resultados mostraron un rango de LT entre 1.622 pb y 13.845 pb, con media global de 6.301 pb y mediana de 5.706 pb. El análisis estadístico reveló un acortamiento progresivo de la LT con la edad, con mayor notoriedad en los grupos jóvenes y una posible estabilización en mayores de 60 años. No se observaron diferencias significativas por sexo, mientras que la presencia de HII se asoció a valores más bajos de LT. Telomerecat destacó por su robustez frente a la ploidía y la discriminación de secuencias subteloméricas, consolidándose como la herramienta más adecuada en este contexto.
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    Nombre: carrillodíezjavier_98507_27871 ...
    Tamaño: 992.4Kb
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